虽然最近在许多科学领域都变得无处不在,但对其评估的关注较少。对于分子生成模型,最先进的是孤立或与其输入有关的输出。但是,它们的生物学和功能特性(例如配体 - 靶标相互作用)尚未得到解决。在这项研究中,提出了一种新型的生物学启发的基准,用于评估分子生成模型。具体而言,设计了三个不同的参考数据集,并引入了与药物发现过程直接相关的一组指标。特别是我们提出了一个娱乐指标,将药物目标亲和力预测和分子对接应用作为评估生成产量的互补技术。虽然所有三个指标均在测试的生成模型中均表现出一致的结果,但对药物目标亲和力结合和分子对接分数进行了更详细的比较,表明单峰预测器可能会导致关于目标结合在分子水平和多模式方法的错误结论,而多模式的方法是错误的结论。因此优选。该框架的关键优点是,它通过明确关注配体 - 靶标相互作用,将先前的物理化学域知识纳入基准测试过程,从而创建了一种高效的工具,不仅用于评估分子生成型输出,而且还用于丰富富含分子生成的输出。一般而言,药物发现过程。
translated by 谷歌翻译